Первое упоминание о сельце Высоком, вотчине «волочанина Неустроя Андреева сына Зароцкого» имеется в писцовых книгах 1627 г. Следующие владельцы села носили фамилию Таракановы. От них село и получило свое теперешнее название. Стольник Никита Ксенофонтович Тараканов построил в селе Высоком первую деревянную церковь во имя Архистратига Михаила, в которую в 1694 г. освятили.
В XVIII в. капитан Иван Васильевич Тараканов построил взамен сгоревшей деревянной уже каменную Михаило-Архангельскую церковь с приделами во имя святителя Николая Чудотворца и апостола и евангелиста Иоанна Богослова. Храмозданную грамоту он получил 9 февраля 1755 г.
Церковь Михаила Архангела в селе Тараканово является оригинальным образцом центрических храмов середины XVIII в. Выстроенный в формах барокко, храм представляет в плане равноконечный греческий крест. Местоположение «барской» Таракановской церкви было неудобно для прихожан. Центром округи в XIX в. стал старый деревянный храм на погосте Николы-на-Лутосне, расположенный на противоположном берегу речки Лутосни.
В 1823 г. в Тараканово совершалось лишь 3—4 службы в год. Значение «барской» церкви совершенно потерялось с постройкой в 1854 г. на Никольском погосте обширного каменного храма в честь Покрова Богородицы. Отклонение покачнувшейся колокольни со временем усилилось, и в 1874 г. ее пришлось сломать.
По проекту архитектора Грудзина построили временную деревянную на каменном основании звонницу, в 15 метрах от храма. В 1903 г. в Михаило-Архангельской церкви поэт А.А.Блок венчался с Л.Д.Менделеевой.
В 1904 г. колокольню собирались ломать, однако она простояла до 1936 г., когда и была снесена. В 1921 г. в крест попала молния, пробила купол, и храм внутри загорелся. Пожар потушили, повреждённые элементы восстановили.
Последний настоятель храма священник Николай Пятницкий был арестован, и расстрелян 16 ноября 1937 г. на Бутовском полигоне под Москвой. 14 августа 2000 года причислен к лику святых Юбилейным Архиерейским Собором Русской Православной Церкви.
В 1928 г. церковь закрыли и переоборудовали под клуб. В1930—1940 гг. здание использовалось под овощехранилище. Во время Великой Отечественной войны церковь сильно пострадала от удара взрывной волны. Дальнейшее разрушение совершило время.
До наших дней сохранился центральный восьмигранный объем и южный придел храма.
Осенью 1978 г. началась консервация церкви, остановленная из-за отсутствия средств.
В 2002 г. в храм был назначен настоятель. В настоящее время все богослужения проводятся в приписном храме-часовне священномученика Николая (Пятницкого), который располагается рядом с входом в музей-усадьбу капитана Тараканова.
В конце 2016 г. начались активные работы по восстановлению храма. 20 октября 2017 г. на купол восстанавливаемого храма был воздвигнут крест.
Престольные праздники:
- Архангела Михаила — Сентябрь 19 [по н.с.], Ноябрь 21 [по н.с.]
- Иоанна Богослова — Май 21 [по н.с.], Июль 13 [по н.с.] (Собор 12-ти апостолов), Октябрь 9 [по н.с.] (день преставления)
- Николая Чудотворца — Май 22 [по н.с.] (перенесение мощей), Декабрь 19 [по н.с.]